یکی از مهمترین چالشهایی که صندوق پروژه و ابزارهای مبتنی بر پروژه دارند این است که میزان تأمین مالی که از طریق این ابزارها انجام میشود، برای انجام پروژههای بزرگ مقیاس کارآمد نیست خصوصا به دلیل اینکه طول دوره ساخت پروژه طولانی است.